PON AIM

Proposta-Attività: AIM1804798-2

Descrizione del Progetto

Il progetto finanziato nell’ambito del Programma Operativo Nazionale (PON) per la ricerca e innovazione ha come principale obiettivo quello di fornire informazioni al livello genomico sulla biodiversità di bovini ed ovi-caprini al fine di individuare adeguate strategie di miglioramento genetico, di conservazione e valorizzazione della biodiversità locale.

Metodologie

Il Dipartimento AAA è responsabile del coordinamento di due principali database (BIOVITA e BOVITA) di dati di polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) che includono molte razze locali di ovini (es. Gentile di Puglia e Merinizzata Italiana) e Bovini (es. Podolica Italiana, Chianina e Maremmana). I dati di SNP vengono processati mediante metodologie bioinformatiche al fine di ricostruire le relazioni genomiche tra le differenti razze, individuare firme di selezione per tratti importanti per la produzione zootecnica con conseguente individuazione di strategie di conservazione e valorizzazione dei prodotti. Questi primi mesi di lavoro hanno portato alla sottomissione di alcuni articoli scientifici inerenti alla diversità di razze autoctone di bovini.

Pubblicazioni

Salvatore Mastrangelo¹, Marco Tolone¹, Slim Ben Jemaa², Gianluca Sottile³, Rosalia Di Gerlando¹, Oscar Cortés⁴, Gabriele Senczuk⁵, Baldassare Portolano¹, Fabio Pilla⁵, Elena Ciani⁶ and BOVITA project. Refining the genetic structure and relationships among European cattle populations with a special focus on Italian breeds using medium-density SNP data. Accepted to Scientific Reports.

Gabriele Senczuk¹, Salvatore Mastrangelo^2*, Elena Ciani³, Luca Battaglini⁴, Filippo Cendron⁵, Roberta Ciampolini⁶, Paola Crepaldi⁷, Roberto Mantovani⁵, Giulio Pagnacco⁸, Baldassare Portolano², Attilio Rossoni⁹, Fabio Pilla¹, Martino Cassandro⁵.  The genetic heritage of Alpine local cattle breeds using genomic SNPs data. Under revision to Genetics Selection and Evolution.

Gabriele Senczuk¹, Lorenzo Guerra², Salvatore Mastrangelo³, Claudia Campobasso², Kaouadji Zoubeyda⁴, Meghelli Imane⁴, Andrea Criscione⁵, Szilvia Kusza⁶, Taki Karsli⁷, Samir Bachir Souheil Gaouar⁴, Fabio Pilla¹, Elena Ciani², and The Bovita Consortium. Fifteen shades of grey. Combined analysis of genome-wide SNP data in Steppe cattle and in Mediterranean grey cattle shed new light on the molecular bases of coat color. To be submitted to Frontiers in Ecology and Evolution.

Gabriele Senczuk¹, Salvatore Mastrangelo³, Elena Ciani², Fabio Pilla¹. Into the origin of Podolian cattle breeds by using medium-density SNP data. In preparation.