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Proposta-Attività: AIM1804798-2

Descrizione del Progetto

Il progetto finanziato nell’ambito del Programma Operativo Nazionale (PON) per la ricerca e innovazione ha come principale obiettivo quello di fornire informazioni al livello genomico sulla biodiversità di bovini ed ovi-caprini al fine di individuare adeguate strategie di miglioramento genetico, di conservazione e valorizzazione della biodiversità locale.

Metodologie

Il Dipartimento AAA è responsabile del coordinamento di due principali database (BIOVITA e BOVITA) di dati di polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) che includono molte razze locali di ovini (es. Gentile di Puglia e Merinizzata Italiana) e Bovini (es. Podolica Italiana, Chianina e Maremmana). I dati di SNP vengono processati mediante metodologie bioinformatiche al fine di ricostruire le relazioni genomiche tra le differenti razze, individuare firme di selezione per tratti importanti per la produzione zootecnica con conseguente individuazione di strategie di conservazione e valorizzazione dei prodotti. Questi primi mesi di lavoro hanno portato alla sottomissione di alcuni articoli scientifici inerenti alla diversità di razze autoctone di bovini.

Pubblicazioni

Salvatore Mastrangelo1, Marco Tolone1, Slim Ben Jemaa2, Gianluca Sottile3, Rosalia Di Gerlando1, Oscar Cortés4, Gabriele Senczuk5, Baldassare Portolano1, Fabio Pilla5, Elena Ciani6 and BOVITA project. Refining the genetic structure and relationships among European cattle populations with a special focus on Italian breeds using medium-density SNP data. Accepted to Scientific Reports.

Gabriele Senczuk1, Salvatore Mastrangelo2*, Elena Ciani3, Luca Battaglini4, Filippo Cendron5, Roberta Ciampolini6, Paola Crepaldi7, Roberto Mantovani5, Giulio Pagnacco8, Baldassare Portolano2, Attilio Rossoni9, Fabio Pilla1, Martino Cassandro5.  The genetic heritage of Alpine local cattle breeds using genomic SNPs data. Under revision to Genetics Selection and Evolution.

Gabriele Senczuk1, Lorenzo Guerra2, Salvatore Mastrangelo3, Claudia Campobasso2, Kaouadji Zoubeyda4, Meghelli Imane4, Andrea Criscione5, Szilvia Kusza6, Taki Karsli7, Samir Bachir Souheil Gaouar4, Fabio Pilla1, Elena Ciani2, and The Bovita Consortium. Fifteen shades of grey. Combined analysis of genome-wide SNP data in Steppe cattle and in Mediterranean grey cattle shed new light on the molecular bases of coat color. To be submitted to Frontiers in Ecology and Evolution.

Gabriele Senczuk1, Salvatore Mastrangelo3, Elena Ciani2, Fabio Pilla1. Into the origin of Podolian cattle breeds by using medium-density SNP data. In preparation.